婴幼儿食物过敏大多由牛奶、鸡蛋、坚果(常见为花生)、向日葵、大豆、小麦和海鲜蛋白引起,这些食物是婴幼儿膳食中最基本成分,所以并不提倡经验性避免进食这些食物,对于正处于生长发育的婴幼儿来说“可能由过敏引起的皮肤病等问题是小事，营养不良才是大事”。只有通过完整的检查确定由食物过敏才采取避免进食的方法。食物过敏一旦被确诊,避免进食，是最好治疗方法。但较长时间禁食过敏食物，可能造成营养不良或饮食障碍，尤其是生长发育期的婴幼儿。牛奶过敏的患儿避食牛奶后，测量其平均身高及体重，结果其身高明显低于正常同龄儿。所以对婴幼儿食物过敏除了诊断要十分明确外，至少每年要复查一次是否仍对该食物过敏。大部分患儿在避食过敏食物1一2年后对该食物的敏感性消失。要严密观察避食儿童的生长发育速度，并可进食少量避食的食物以确定是否要继续避食(有严重反应者除外)。最理想方法是通过咨询营养师,教育父母如何避免食物过敏原又能保障儿童能得到充足的营养,保证牛奶过敏的儿童获得钙的吸收。
年幼儿在母乳喂养时，因母亲摄入蛋白可在乳汁存留数日，故母亲的饮食应加以限制进食牛奶或鸡蛋等婴儿敏感的食物，而无须停止母乳喂养，但应避免营养不良。
年长儿情况则较为复杂，尤其是怀疑多种食物过敏者。由于对食物组成成分很难做到详细了解，故其管理有一定的困难和缺陷。但应重视以下两方面：购物时详细了解食物组成成分，如对不能进食牛奶者，不仅要避免所有奶产品，而且要避免进食所有含牛奶蛋白的食物。
为了避免明确的食物过敏又保障儿童能得到充足的营养，积极寻找相关食物替代品非常重要，特别是以牛奶、鸡蛋作为基本营养来源的婴幼儿。
对牛奶过敏者，可试用羊奶、马奶，豆奶或者用低抗原配方奶等代替。对鸡蛋过敏者大多涉及蛋清即蛋白部分，只避食蛋清即可，仍可进食蛋黄。
以牛乳为基础的普通配方奶中的酪蛋白和乳清蛋白分子量较大,抗原性较强。低抗原配方奶通过内切型蛋白酶和外切型蛋白酶的协同作用,将大分子的蛋白水解为小分子的短肽,抗原性仅为普通配方奶的万分之一,能有效地降低过敏性疾病的发生。低抗原配方奶对于伴有过敏遗传因素的婴儿,能显著降低过敏的发生,减轻过敏症状,而且具有与普通配方奶相当的营养学价值。因此,建议有过敏家族史的婴儿应给予低抗原配方奶喂养。
但是少部分对牛奶过敏的宝宝食用低敏奶粉后仍然会继续发生湿疹或腹泻，这些孩子只好选择氨基酸奶粉了。氨基酸奶粉中没有大分子蛋白质，只有氨基酸，不会发生过敏反应。
此外,低过敏豆制品，低过敏大米以及其它低过敏谷物制品的开发也早有报道。
